Στην οδοντιατρική το φθόριο χρησιμοποιείται για την πρόληψη της τερηδόνας χάρη στις αντιμικροβιακές του ιδιότητες και στην ικανότητα να απορροφάται από την αδαμαντίνη των δοντιών καθιστώντας την, έτσι, πιο ανθεκτική στην τερηδονική προσβολή.

Η ευεργετική του δράση έχει δειχθεί ότι οφείλεται κυρίως στην τοπική παρά στη συστηματική του χορήγηση. Στο σπίτι η πρόσληψη του φθορίου γίνεται με την  καθημερινή χρήση φθοριούχου οδοντόκρεμας κατά το βούρτσισμα των δοντιών με συγκέντρωση φθορίου κατάλληλη για την ηλικία του παιδιού.

Στο ιατρείο πραγματοποιείται η διαδικασία της φθορίωσης, δηλαδή της τοπικής επάλειψης στην επιφάνεια των δοντιών φθοριούχου ζελέ με αυξημένη συγκέντρωση φθορίου. Η φθορίωση των δοντιών μπορεί να γίνεται  μία φορά τον χρόνο ή και περισσότερες (3-4) ανάλογα με τον κίνδυνο του παιδιού να εμφανίσει τερηδονικές βλάβες.

Η σωστή, ελεγχόμενη και εξατομικευμένη  χρήση του φθορίου αποτελεί μια ασπίδα προστασίας απέναντι στη τερηδονική νόσο.